Je n'utilise pas Gimp et je ne peux pas vraiment t'aider, mais je pense que ton problème est dû au format d'enregistrement de ton image.
Pour que la transparence soit reconnue par internet, il faut que ta signature soit enregistrée en .png et non en .jpg, je pense que c'est à cause de cela que tu n'arrives pas à mettre ta transparence.
En espérant avoir aidé. =)